Das Rathaus erfüllt verschiedene Funktionen: Es ist Tagungsort des Stadtrates und der Ausschüsse. Dem Stadtrat gehören 42 Ratsmitglieder sechs unterschiedlicher Fraktionen an.

Gleichzeitig ist das Rathaus Sitz der Stadtverwaltung. Die Stadtverwaltung untergliedert sich in vier Vorstandsbereiche, wobei sich der Vorstandsbereich III, dem die Fachbereiche Bildung, Kultur, Sport, Arbeit und Soziales sowie Jugend zugeordnet sind, im Nebengebäude, dem ehemaligen Finanzamt, befindet. In den beiden Rathäusern arbeiten 140 Angestellte und Beamte, insgesamt beschäftigt die Stadt nahezu 400 Menschen aus Ahaus und Umgebung.